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钩端螺旋体细菌的进化和多样性
钩端螺旋体病是一种新兴的人畜共患疾病,每年影响全世界超过一百万人。据报道,PLOS被忽视的热带病的研究人员已经对从全球环境中收集的钩端螺旋体的基因组进行了测序,并揭示了30种新物种和物种多样性的新模式。
钩端螺旋体属目前分为35个物种,分为三个系统发育簇,其历史上与物种的致病性水平相关:腐生,中间和致病。这些星团的演化尚不清楚,许多物种的毒力状态尚不清楚。
在这项新工作中,来自巴斯德研究所国际网络(IPIN)的一组研究人员,包括法国巴斯德研究所的Mathieu Picardeau和Pascale Bourhy,加拿大INRS-Institut Armand-Frappier的FrédéricVeyrier和其他同事进行了研究。钩端螺旋体菌株分布在四大洲的18个地点,包括日本,马来西亚,新喀里多尼亚,阿尔及利亚,法国和马约特岛。对每种分离物的基因组进行测序,并与已知的钩端螺旋体基因组进行比较。
基于遗传序列,该团队能够识别30种新的钩端螺旋体物种。他们组织了钩端螺旋体属,现在包括64种,分为四个谱系或亚类,分别为P1,P2,S1和S2。从未描述过S2子叶。在P1(以前称为致病谱系)中,他们揭示了基因组重新加工的现象,这可以解释它们的进化致病性。
“我们已经剔除了钩端螺旋体属,并且更加清晰地了解其多样性,这将有助于研究人员提出其分类和命名的新标准。几种新的潜在感染性钩端螺旋体物种对人类和动物健康的影响仍有待确定,但我们的数据也是如此研究人员表示,对致病物种的毒力出现提供了新的见解。
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